糖基化是在酶的控制下在蛋白质或脂质上附加糖类的过程,起始于内质网,结束于高尔基体。在糖基转移酶作用下将糖转移至蛋白质,和蛋白质上的氨基酸残基形成糖苷键,并在糖基转移酶和糖苷酶的剪切、加工下形成各种类型的糖链。
糖基化蛋白质组学的核心任务是利用组学的手段,从全局上去寻找发生糖基化修饰的位点,解析糖链的结构,鉴定完整的糖肽,探索糖蛋白在生命活动中扮演的角色和生物学功能。
采用亲水作用色谱在肽段层面富集完整N-糖肽,提高了富集效率;
采用二甲基标记定量技术,提高定量的准确性;
利用自主开发的GPSeeker软件,可实现对完整N-糖肽的定性和定量分析。
N-糖基化修饰的糖链结构解析(适用甘露糖型、复合型、杂合型N-糖链);
寻找疾病相关蛋白糖基化修饰规律;
分析糖蛋白糖链和糖结合蛋白相互作用的关联性;
探讨糖类相关基因和糖结合蛋白基因调控机制;
助力抗体药物质量评价。
1、需鉴定的样品;
2、样品信息单:需详细填写样品物种、来源、含量、状态及其他基本信息。
实验报告一份,含具体实验流程及糖蛋白质组学鉴定及定量结果(生物信息学分析)。
生物信息学分析内容包括:
糖蛋白、N-糖基化修饰位点、完整N-糖肽的数目、完整N-糖肽的定量信息、位点糖链的糖型及结构。
鉴定结果特征分布:肽段长度、蛋白覆盖度分布、unique肽段分布;
糖蛋白的GO功能分类、COG注释、Pathway通路注释;
糖蛋白Domain预测;
糖蛋白亚细胞定位;
糖蛋白蛋白网络互作预测。
自送样起40-60个工作日。
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