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蛋白质很少单独发挥作用，在所有生物功能中，蛋白复合体的功能占主导地位。在所有细胞中，蛋白质是最重要的组成部分，并且在大多数细胞功能中蛋白质间的相互作用是最基本的活动
SWATH定量蛋白质组学方法确定蛋白复合体的成分是SWATH定量方法最常用的应用之一。
金开瑞借助高精度质谱平台，开发了一套从实验到生物信息分析的AP-SWATH流程，采用TAP技术将目标靶蛋白的相互作用蛋白特异性富集，然后结合具有高灵敏度、高准确度、高通量等特点的SWATH定量技术，能够高特异性的准确富集到靶蛋白的特异性相互作用蛋白，实现蛋白复合体的准确鉴定。
技术特点
1、采用AP-SWATH技术，不需要过多的背景知识就可以得到大量含靶蛋白的复合体；
2、蛋白表达及与复合物的结合都接近生理水平；
3、采用两步亲和纯化，大大提高了纯化产物的特异性。
适用范围
TAP更倾向于高丰度和稳定的相互作用，许多低亲和力、瞬时和依赖特殊细胞环境的相互作用可能检测不到
特别适用于研究蛋白质在生理条件下的相互作用
一次实验只能检测一个蛋白的相互作用蛋白
1、采用AP-SWATH技术，不需要过多的背景知识就可以得到大量含靶蛋白的复合体；
2、蛋白表达及与复合物的结合都接近生理水平；
3、采用两步亲和纯化，大大提高了纯化产物的特异性。
适用范围
TAP更倾向于高丰度和稳定的相互作用，许多低亲和力、瞬时和依赖特殊细胞环境的相互作用可能检测不到
特别适用于研究蛋白质在生理条件下的相互作用
一次实验只能检测一个蛋白的相互作用蛋白
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